Sekolah Dasar Islam Tompokersan Lumajang didirikan pada tanggal 5 Agustus 1963, diprakarsai oleh Ibu Hj. Zanifah, BA bersama dengan ibu – ibu yang tergabung sebagai pengurus Yayasan Pendidikan Muslimat NU Cabang Lumajang. Sebagai dasar pemikiran dan pertimbangan pendirian Sekolah Dasar Islam pada saat itu adalah mengingat masih minimnya sarana pendidikan dasar yang bernuansa Islami, namun dengan muatan pengetahuan umum yang memadai, sesuai kurikulum yang berlaku. Dari hasil analisis situasi dan kondisi serta musyawarah yang dilakukan, maka diputuskan bahwa proses pembelajaran Sekolah Dasar yang bernuansa Islami harus segera terwujud dan beroperasi.
Dengan modal personil dan guru terbatas yang dihimpun dari para lulusan SPG Negeri Lumajang serta belum adanya gedung sekolah yang permanen, maka dimulailah proses belajar mengajar di Sekolah Dasar Islam ini dengan kurang lebih 20 murid untuk kelas pertama yang sebagian besar putra – putri para pengurus sendiri dan dengan menggunakan gedung kelas di sebuah rumah di Jl Kapt Kyai Ilyas No. 12 Lumajang yang saat ini menjadi gedung permanen Sekolah Dasar Islam Tompokersan Lumajang.
Melalui berbagai upaya yang dilakukan dengan bermodalkan semangat yang sangat tinggi dan penuh keikhlasan dari para pengurus untuk memajukan proses belajar mengajar yang dilaksanakan, upaya ini telah memberikan hasil yang menggembirakan dengan ditandai adanya lulusan pertama ujian persamaan SD Negeri di Lumajang dengan prosentase + 80 % pada tahun 1969.
Dalam upaya merencanakan pengajaran yang dapat memberikan hasil yang lebih baik, dalam arti dapat melibatkan siswa untuk secara aktif dalam belajar, serta dapat memberikan motivasi yang tinggi dalam proses belajar mengajar, selanjutnya didirikan gedung secara permanen pada tahun 1970. Sejalan dengan perkembangan SD Islam Tompokersan yang semakin banyak peminatnya karena para orang tua lebih menyadari pentingnya pembentukan keimanan dan akhlaq sedini mungkin pada anak tanpa mengurangi muatan pengetahuan umum, sehingga sampai tahun 2023 dalam usia yang ke 59 SD Islam Tompokersan Lumajang yang pada saat ini dibawah naungan Yayasan Pendidikan Islam “ Nurul Masithah” Lumajang dengan dukungan guru – guru yang profesional tahun 2005 sampai dengan tahun 2022 telah mampu meluluskan +- 1787 siswa dengan beberapa prestasi yang membanggakan sebagai suatu lembaga Pendidikan Islam di samping serta banyak dari alumni yang berhasil menduduki profesi yang cukup penting dimasyarakat.
Saat ini SD Islam Tompokersan Lumajang sebagai sosok baru dalam dunia pendidikan, menerapkan sistem Full-day School Full-day Education (sekolah sepanjang hari pendidikan sepanjang hari). Berbeda dengan sekolah ada umumnya, sekolah ini menerapkan dasar “integrated Curriculum” dan “Integrated Activity” dimana hampir seluruh aktivitas anak ada di sekolah mulai dari belajar bermain, makan dan beribadah, berinteraksi sosial semua dikemas dalam satu sistem pendidikan. Penanaman nilai-nilai islami dan qur’ani data dilakukan sejak dini terhadap anak didik dan pengawasan guru terhadap anak didik lebih intensif.